灰指甲一般是由真菌感染引起，目前灰指甲患者中60％~90％是由皮肤癣菌感染引起，由皮肤癣菌引起的患者治愈率可达90％。目前认为甲癣的致病一般都是传染而来，患者在有甲外伤、免疫力低下的情况下容易发病。另外体内血糖水平高，皮肤和指（趾）甲内含糖高，也有利于真菌生长。此外，现在发现广东地区发病率较高可能与湿度大和由于工作压力大、精神紧张等导致免疫功能不平衡有关。另外血糖高人士都容易“中招”，而且容易复发和再感染。

一般而言，免疫力低下、代谢功能低，有糖尿病、结缔组织病或有先天性自身免疫缺陷的人容易得甲癣。临床发现该病与患者所处环境、职业有关，如经常与泥土打交道的农事人员，常在潮湿环境中工作的人都容易得病。

从季节上来说，该病易在春夏发病，而且目前发现部分天生有易感性，而且与家族有一定关系，也就是有在家族中人员多发的特征规律。