影响泌尿系结石形成的内在因素主要有以下几个方面：

    1）性别：男性多于女性，上尿路结石男女之比为4：1，而下尿路结石则为23．7：l，其原因可能为男性血睾酮水平高，而雄激素有促草酸形成作用，这使男性内源性草酸盐产生较女性多，易形成结石，同时女性尿中枸橼酸含量较高，而枸橼酸是抑制结石形成的因素。近年来女性的发病率有逐渐增加的趋势。

    2）年龄：尿石症好发于20～50岁，多数在20岁左右开始出现症状，Alkel（1986）统计欧洲15岁以下尿石症患者仅占总数的1％～5％，儿童期结石以下尿路结石居多，前列腺增生引起下尿路梗阻为老年性结石的重要原因。

    3）种族遗传：虽然人们对结石病与遗传关系进行了几个世纪的研究，目前仍不完全明了二者之间的联系。世界上各个种族的发病率有很大差异。在非洲，黑人发病率较当地白人低，在埃及阿拉伯人发病率亦高于当地黑人，其具体原因尚不完全清楚，可能与黑人尿钙水平低，尿钠水平高，同时黑色皮肤可使人体减少紫外线吸收致维生素D生成减少及黑人尿中大分子抑制物较多等因素有关。尿石症与遗传因素有关，Crcom(1932)首先提出尿石症是常染色体显性遗传。

    有学者认为29．4％的肾结石患者有家族史，近亲结婚者发病率更高。有些类型的尿石症已被证实了为遗传病，如胱氨酸尿症和原发性草酸尿症都是常染色体隐性遗传病，患者肾小管对尿中胱氨酸、鸟氨酸、精氨酸和赖氨酸四种氨基酸重吸收障碍，引起尿胱氨酸过饱和度增高而析出成石。原发性肾小管酸中毒是一种常染色体显性遗传病，其中l型可合并尿石症。

    近年来对原发性高尿钙的遗传因素的研究日益受到重视，目前研究发现草酸钙结石病人中约14％有家族性草酸钙结石或高尿钙病史。更有人发现尿石症患者配偶也有尿钙排泄增加，这提示结石形成可能与家庭因素有关。

    4）代谢性疾病：原发性甲状旁腺功能亢进是与尿石症关系最为密切的疾病，患者甲状旁腺激素增多，引起血钙升高，尿钙及尿磷排泄增加，促使尿石形成。甲状旁腺功能亢进者60％合并肾结石。长期卧床的制动综合征35％～80％可合并尿路结石，长期卧床，引起骨骼废用性脱钙，使尿钙，尿磷、尿酸均明显高于正常人。

    有文献报道宇航员失重后亦有类似的脱钙现象。其他能引起高血钙和高尿钙代谢异常盼疾病均易产生尿结石，如维生素D过多，多发性骨髓瘤、结节病、库欣综合征等，除了钙代谢紊乱，尿酸、胱氨酸、黄嘌呤代澍异常均能形成相应的结石。肠大部切除或短路可影响草酸在肠道内与钙的结合，诱发尿酸结石及草酸钙结石生成。

    5）泌尿系疾病：有许多资料表明尿路梗阻、感染、异物等是结石形成的重要原因。尿道狭窄、前列腺良性增生、肾盂输尿管连接部狭窄、马蹄肾等均可产生尿潴留、尿液浓缩，使尿中晶体物质析出沉淀形成结石。尿路感染时尿中细菌、脓液、脱落上皮可成为尿液中结石的“核心”部分，变形杆菌还能产生尿素酶，在分解尿素产生氨的同时提高尿pH值，使尿液碱化，这有利于磷酸盐沉淀，并破坏尿中晶体与胶体的相对平衡，促进结石形成、生长。尿路中的线头、导管、发夹等异物往往被尿中粘蛋白附着，然后逐渐沉积形成结石。异物还易引起继发性感染从而诱发结石形成。